R语言的数据转换: split – apply – combine 模式（上b）：baseR

3 base包中的apply( )函数族
接下来的apply – combine步骤主要由apply函数族完成。对于R的初学者来说，apply函数族以其强大的向量运算功能，把for循环语句送到了被遗忘的角落，这种震撼效果，无异于天赐神器。但是，这些冠以*apply的函数，也经常让人使用混乱，找不着方向。
那么*apply包括哪些函数呢？在 R console中键入??apply,可以看到在base包中包含如下函数：（*apply在别的包里还有起到各自功能的相关函数，我们只看涉及数据转换的这些个）
 apply ：Apply Functions Over Array Margins
 by ：Apply a Function to a Data Frame Split by Factors
 eapply ：Apply a Function Over Values in an Environment
lapply ：Apply a Function over a List or Vector
mapply ：Apply a Function to Multiple List or Vector Arguments
rapply ：Recursively Apply a Function to a List
tapply ：Apply a Function Over a Ragged Array
除此之外，还有可作为lapply变形的sapply，vapply和 replicate，共计10个函数。
在漫长的介绍和例子开始之前,先来看看*apply们的基本功能和它们的关系
                
                
(1) apply
apply函数通过对数组，矩阵，或非空维数值的数据框的“边缘”（margin）即行或列运用函数。返回值为向量，数组或列表。
函数形式
apply(X, MARGIN, FUN, ...)
其中，X：数组（矩阵）；
MARGIN：函数要作用的下标向量，对于矩阵，1表示行，2表示列，1：2表示行和列；
FUN：函数名或函数表达式。
##例
> m<-matrix(c(1:4,1,4,1:6),ncol=3)
> apply(m,1,mean)
[1] 1.666667 3.333333 3.000000 4.000000
> apply(m,2,sd)
[1] 1.290994 1.414214 1.290994
> apply(m,1:2,function(x) x*2)
     [,1] [,2] [,3]
[1,] 2 2 6
[2,] 4 8 8
[3,] 6 2 10
[4,] 8 4 12
> apply(m,2,table) #返回的是列表
 [ [1] ]
1 2 3 4
1 1 1 1
……
> apply(m, 1, stats::quantile) #各行的分位数，返回矩阵
     [,1] [,2] [,3] [,4]
0% 1 2 1 2
25% 1 3 2 3
50% 1 4 3 4
75% 2 4 4 5
100% 3 4 5 6
(2) by
 
  by函数是tapply的一个面向用户的友好包装版，是一个使用因子来对数据框按行进行分组并对每个子集运用函数的方法。它的对象数据被默认强制转换为数据框。它返回一个 类属性为by的对象，simplify i= false是，返回值是列表，否则是列表或数组。
by(data, INDICES, FUN, ..., simplify = TRUE)
#例 使用著名的鸢尾花数据iris
> attach(iris)
> head(iris)
   Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
1 5.1 3.5 1.4 0.2 setosa
2 4.9 3.0 1.4 0.2 setosa
3 4.7 3.2 1.3 0.2 setosa
4 4.6 3.1 1.5 0.2 setosa
5 5.0 3.6 1.4 0.2 setosa
6 5.4 3.9 1.7 0.4 setosa
> by(iris[, 1:4], Species, mean)
Species: setosa
Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width
       5.006 3.428 1.462 0.246
---------------------------------------------------------
Species: versicolor
Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width
       5.936 2.770 4.260 1.326
---------------------------------------------------------
Species: virginica
Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width
       6.588 2.974 5.552 2.026